晶能生物技術(shù)(上海)有限公司(簡稱晶能生物)是博愛新開源制藥股份有限公司全資子公司(股票代碼:300109),是一家專注于醫(yī)療、健康、科技服務(wù)技術(shù)研發(fā)和應(yīng)用的高新技術(shù)企業(yè)。
晶能生物擁有國際最先進的高通量測序,基因芯片,單分子光學(xué)圖譜,生物信息和分子生物學(xué)技術(shù)平臺,專業(yè)提供科技服務(wù)整體解決方案和健康臨床服務(wù)。晶能生物通過國際ISO9001:2008質(zhì)量體系認(rèn)證和國家3A企業(yè)信用認(rèn)證,加盟上海研發(fā)公共平臺,獲得上海高新技術(shù)企業(yè),發(fā)明專利和軟件著作權(quán)16項。
晶能生物公司標(biāo)志設(shè)計時抓住中國醫(yī)療健康產(chǎn)業(yè)快速成長的巨大機遇,成立晶能創(chuàng)新醫(yī)療健康研究中心,研發(fā)團隊囊括國際頂尖科學(xué)家,中國國家千人公司LOGO設(shè)計學(xué)者以及國內(nèi)知名院校醫(yī)院在內(nèi)的資深專家,以精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)和基因檢測為導(dǎo)向,致力于研發(fā)腫瘤和遺傳病健康與臨床產(chǎn)品。相關(guān)設(shè)計:中國科學(xué)院東南亞生物多樣性研究中心
晶能生物奉行客戶第一、服務(wù)至上、共同成長、持續(xù)發(fā)展的原則,始終懷著感恩的心態(tài),努力做一個讓客戶、員工、股東、社會滿意的企業(yè),成為醫(yī)療健康和科技服務(wù)的領(lǐng)導(dǎo)性公司。
2015年曙光服務(wù)器到位
5月曙光服務(wù)器到位
4月Hiseq3000測序平臺到位
2月榮獲“2014年度上海研發(fā)公共服務(wù)平臺最具發(fā)展?jié)摿Ψ⻊?wù)機構(gòu)”榮譽稱號1月Hiseq3000測序平臺到位
2014年晶能榮獲國家“高新技術(shù)企業(yè)證書”
10月晶能榮獲國家“高新技術(shù)企業(yè)證書”6月晶能獲得6個計算機軟件著作證書
3月晶能通過ISO9001:2008質(zhì)量體系認(rèn)證2013年晶能完成8萬個SNP樣本;Miseq平臺到位
9月晶能完成8萬個SNP樣本;Miseq平臺到位
8月晶能正式加盟上海研發(fā)公共服務(wù)平臺
3月晶能成為全國首家BioNano認(rèn)證服務(wù)商1月illumina Hiseq2000正式升級為2500
2012年晶能榮獲國家“高新技術(shù)企業(yè)證書”
12月晶能榮獲國家“高新技術(shù)企業(yè)證書”
10月晶能完成第二篇GWAS新盤實驗發(fā)表在Nature Genetics;晶能成為illuminaCSPro認(rèn)證服務(wù)商
9月晶能完成的GWAS芯片實驗發(fā)表在Nature Genetics;完成1000個外顯子測序項目
2010年晶能公司成立
12月illumina Hiseq2000測序平臺到位;國內(nèi)第一個完成Omin系列芯片實驗平臺
9月illumina iScan芯片臺到位
8月晶能技術(shù)中心成立sequenom到位
2月晶能公司成立
徐劍鋒
醫(yī)學(xué)碩士/公共衛(wèi)生博士/復(fù)旦大學(xué)“千人公司LOGO設(shè)計”
研究方向
徐劍鋒教授是美國維克森林大學(xué)醫(yī)學(xué)院的終身教授和腫瘤基因組中心主任,主要從事遺傳流行病學(xué)、腫瘤基因組學(xué)和轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)研究,利用全基因組關(guān)聯(lián)分析和腫瘤基因組研究,篩選并鑒定與疾病發(fā)生和預(yù)后相關(guān)的基因,將研究成果轉(zhuǎn)化為臨床應(yīng)用,包括疾病個體化預(yù)防、篩查、診斷和治療等。已發(fā)表了近200篇SCI論文,包括~20篇新英格蘭醫(yī)學(xué)雜志,自然遺傳雜志,科學(xué)雜志。
工作業(yè)績
2010年,徐劍鋒教授作為“千人公司LOGO設(shè)計”學(xué)者受聘于華山醫(yī)院擔(dān)任泌尿外科研究所所長一職,有豐富的臨床病人和腫瘤組織資源。同時徐劍鋒博士受聘于復(fù)旦大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院特聘教授,并創(chuàng)建了復(fù)旦-文安德遺傳流行病學(xué)研究中心。已組建以基因分型和基因組測序為主的實驗室,以及一批優(yōu)秀的遺傳流行病學(xué)、生物信息學(xué)和數(shù)據(jù)分析研究人員組成的綜合研究團隊。從2014年年中徐劍鋒教授作為晶能生物的專家團隊帶領(lǐng)公司核心技術(shù)和產(chǎn)品的研發(fā),對晶能的發(fā)展起了重要的作用。
教育背景
1979年9月-1984年7月,上海醫(yī)科大學(xué);
1984年9月-1987年7月,上海醫(yī)科大學(xué)公共衛(wèi)生學(xué)院,理學(xué)碩士;
1991年6月-1992年5月,美國約翰霍普金斯大學(xué)公共衛(wèi)生學(xué)院,公共衛(wèi)生碩士;
1993年10月-1997年1月,美國約翰霍普金斯大學(xué)公共衛(wèi)生學(xué)院,遺傳流行病學(xué),公共衛(wèi)生博士。
工作經(jīng)歷及職位
1987年7月-1991年6月,上海醫(yī)科大學(xué)公共衛(wèi)生學(xué)院,講師;
1992年5月-1993年6月,約翰霍普金斯大學(xué)公共衛(wèi)生學(xué)院,博士后研究員;
1993年10月-1997年1月,約翰霍普金斯大學(xué)醫(yī)學(xué)院,遺傳流行病學(xué)家;
1997年6月至今,約翰霍普金斯大學(xué)公共衛(wèi)生學(xué)院,兼職助理教授;
1997年1月-2000年6月,馬里蘭大學(xué),醫(yī)學(xué)助理教授;
2000年6月-2004年6月,美國維克森林大學(xué)醫(yī)學(xué)院,公共衛(wèi)生和腫瘤生物學(xué),副教授;
2004年7月至今:美國維克森林大學(xué)醫(yī)學(xué)院,公共衛(wèi)生和腫瘤生物學(xué),教授;遺傳流行病學(xué),主任;
2005年3月-2008年4月,腫瘤基因和分子流行病學(xué)項目,主管;
2005年3月至今,美國維克森林大學(xué)醫(yī)學(xué)院,人類基因組中心,主任;
2008年5月至今,美國維克森林大學(xué)醫(yī)學(xué)院,腫瘤基因組中心,主任;
2010年3月至今,復(fù)旦大學(xué),泌尿醫(yī)學(xué)研究所,主任。
包雷
生物信息學(xué)博士
研究方向
主要從事生物信息與生物統(tǒng)計的研究
工作業(yè)績
轉(zhuǎn)化生物信息學(xué)共享平臺,2010年–2015年,為UCSD多個PI的轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)科研,提供生物信息和生物統(tǒng)計的共享平臺支持。側(cè)重于臨床實驗設(shè)計和基因組高通量數(shù)據(jù)(特別是二代測序)處理,參與的主要項目包括:1)同時性雙側(cè)乳腺癌外顯子和全基因組測序分析;2)甄別自閉癥和正常兒童群體的RNA測序分析;3)同卵雙生子心血管疾病對吸煙依賴性的全基因組甲基化分析。具有豐富的生物大數(shù)據(jù)和高性能計算平臺搭建方面的經(jīng)驗,精通各種二代測序方案和數(shù)據(jù)分析,包括全基因組和外顯子組測序,RNA-seq、Chip-seq等。
分子診斷,2009年–2010年,在CLIA授權(quán)及CAP認(rèn)證的分子診斷實驗室,從事基于多基因表達(dá)譜的遷移腫瘤分類的專利診斷產(chǎn)品研發(fā),并作為兩位主管統(tǒng)計師之一,深度參與為該產(chǎn)品尋求FDA批準(zhǔn)(510(k) clearance)而開展的大規(guī)模臨床試驗(clinical trial)。具有豐富的生物分子標(biāo)記發(fā)現(xiàn)和鑒定、統(tǒng)計預(yù)測模型構(gòu)建,及建立診斷產(chǎn)品標(biāo)準(zhǔn)操作規(guī)范(SOP)的經(jīng)驗。
癌癥基因組學(xué)和藥物基因組學(xué),利用二代測序和表達(dá)微陣列等高通量技術(shù),來發(fā)現(xiàn)和驗證影響癌癥預(yù)后和藥物治療敏感性的遺傳特征譜(genetic signature)。針對腫瘤特有的組織異質(zhì)性和低豐度突變,開發(fā)專門的二代測序分析工具。
復(fù)雜遺傳病的系統(tǒng)生物學(xué),針對復(fù)雜遺傳病,開發(fā)和利用一系列計算生物學(xué)工具來篩選和鑒定遺傳病易感基因,包括基因組關(guān)聯(lián)分析(GWAS),eQTL分析,人鼠同源疾病比對,調(diào)控網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建,及高通量組學(xué)數(shù)據(jù)整合等。
遺傳突變位點的功能注釋:測序得到的全基因組單核苷酸多態(tài)性(SNP)和其它遺傳突變位點,大多數(shù)是中性突變,只有具有功能的一小部分突變才是遺傳病的潛在位點。為了優(yōu)選功能性的突變,開發(fā)了一系列功能注釋工具,包括編碼區(qū)SNP是否具有破壞蛋白質(zhì)功能的傾向性,非編碼區(qū)SNP是否導(dǎo)致microRNA結(jié)合位點的產(chǎn)生和湮滅,以及非編碼區(qū)SNP是否在絕緣子區(qū)(insulator)從而影響基因的表達(dá)等。
教育背景
1992年-1996年,上海交通大學(xué),生物工程學(xué)士;
1996年-1999年,中科院上海生物化學(xué)研究所,分子生物學(xué)碩士;
1999年-2003年,清華大學(xué),生物信息學(xué)博士。
工作經(jīng)歷及職位
2004年–2006年,田納西大學(xué)健康科學(xué)中心(UTHSC),博士后研究員;
2007年–2008年,弗吉尼亞理工大學(xué)生物信息研究所(Virginia Tech),統(tǒng)計遺傳學(xué)研究員(Statistical Geneticist);
2009年–2010年,生物梅里埃分子診斷公司美國分部(bioMerieux USA),資深統(tǒng)計師(SeniorStatistician);
2010年–2015年,加州大學(xué)圣迭戈分校(UCSD)癌癥中心生物信息與生物統(tǒng)計共享平臺,首席統(tǒng)計師(Principal Statistician);
2015年至今,晶能生物技術(shù)有限公司,生物信息學(xué)專家。
